Am 15. August 1977 wechselte er als Organisationssachbearbeiter zum Hauptamt. Dort war er unter anderem für das Jugendamt zuständig. Für das Sozial‐ und Schulreferat war er ab 1. Dezember 1984 zunächst persönlicher Mitarbeiter von Bürgermeister Wolfgang Dannecker, danach von dessen Nachfolgerin Bürgermeisterin Müller-Trimbusch. Vom 1. Juli 1991 bis zu seinem Ruhestand Ende April 2016 war Bruno Pfeifle Leiter des Jugendamts.
Während seiner rund 25-jährigen Tätigkeit als Amtsleiter hat Bruno Pfeifle für das Jugendamt und für die Jugendhilfe in Stuttgart viel bewirkt. Dazu zählt die sozialraumbezogene Ausrichtung der Angebote des Jugendamts und die damit verbundene Anpassung der Erziehungshilfen zusammen mit den freien Trägern, die Sicherung des Kinderschutzes durch die Einführung neuer Standards wie den Kinderschutzbogen sowie die Einführung des Rechtsanspruchs auf einen Kindergarten‐ und später auch Krippenplatz, wodurch auch die Ganztagesbereiche weiter ausgebaut wurden.
Auch nach seinem Ruhestand war Pfeifle noch einige Jahre in unterschiedlichen sozialen Bereichen aktiv, unter anderem im Vorstand der SOS Kinderdörfer, als Aufsichtsratsvorsitzender des Paritätischen Wohlfahrtsverbands in Baden-Württemberg und als Vorsitzender des Beirats des Dialogforums „Bund trifft kommunale Praxis“ im Deutschen Verein für Kommunalwissenschaften. Noch heute wirkt er in mehreren sozialen Stiftungen mit.